В Telegram-канале правительства РФ говорится, что Никитин родился в 1979 году в Москве и окончил Государственный университет управления по специальности «Государственное и муниципальное управление».
В разные годы он возглавлял «Агентство стратегических инициатив по продвижению новых проектов», после чего стал временно исполняющим обязанности губернатора Новгородской области, а затем и избранным главой этого региона. В 2022 году он был переизбран на второй срок.
С февраля 2025 года Никитин занимает должность заместителя министра транспорта, где курирует цифровую трансформацию, информатизацию и автоматизацию транспортного комплекса, а также разработку и реализацию профильной стратегии развития.
Ранее Никитин назвал устранение сложностей в работе аэропортов главной задачей на новом посту.
Как писала газета ВЗГЛЯД, Владимир Путин подписал указ о временном назначении Андрея Никитина на должность министра транспорта. Пресс-секретарь президента Дмитрий Песков сообщил, что кандидатура Андрея Никитина на пост главы Минтранса была выбрана президентом, поскольку она наилучшим образом отвечает потребностям ведомства.