Ежегодно 31 декабря в Кыргызстане отмечается профессиональный праздник — День работников таможенной службы Кыргызской Республики, установленный постановлением Правительства страны № 98 от 15 февраля 2006 года в целях формирования и обеспечения преемственности традиций таможенной службы Кыргызской Республики.
Указом «Об образовании Государственной таможенной инспекции Республики Кыргызстан» от 31 декабря 1991 года Президент Кыргызстана Аскар Акаев положил начало таможенной политике и таможенному делу суверенного государства. И в 2006 году в честь 15-летнего юбилея данной службы и был учрежден этот профессиональный праздник.
В 2007 году Государственная таможенная инспекция была преобразована в Государственный таможенный комитет Кыргызской Республики, а через два года — в Государственную таможенную службу при Правительстве КР.
Постановлением Правительства страны № 38 от 12 февраля 2021 года Государственная таможенная служба при Правительстве КР была преобразована в Государственную таможенную службу при Министерстве экономики и финансов Кыргызской Республики, с декабря 2021 года — Государственная таможенная служба при Министерстве финансов КР.
Таможенная служба Республики играет значительную роль в формировании новых рыночных отношений, защите экономического суверенитета и экономической безопасности государства, активизации связи кыргызской экономики с мировым хозяйством, обеспечении защиты прав граждан, хозяйствующих субъектов и государственных органов и соблюдения ими обязанностей в области таможенного дела.
В свой профессиональный праздник все сотрудники таможенной службы Республики получают поздравления от руководства и коллег, а особо отличившиеся в работе получают ведомственные награды и подарки.